Йохан Вагенаар (1 ноября 1862 — 17 июня 1941) был голландским композитором и органистом.

Родился в Утрехте вне брака; он был сыном Сиприана Жерара Бергера ван Хенгста и Иоганны Вагенаар. Родители Вагенара принадлежали к разным социальным слоям: его отец был аристократом, а мать происходила из более скромных условий. По этой причине родители Вагенара не были женаты, и он унаследовал фамилию матери. Хотя Вагенаар испытывал недовольство по поводу того, что его родители не поженились, он совершенно не чувствовал себя забытым со стороны отца.

С раннего детства Вагенаар проявлял музыкальные способности. Тем не менее, он начал получать формальное музыкальное образование только в 13 лет, изучая фортепиано, орган, скрипку, теорию музыки и композицию. Его наставниками были композитор Ричард Хол и органист Самуэль де Ланге-младший. В 1892 году он учился у друга Брамса Генриха фон Герцогенберга в Берлине, где специально занимался контрапунктом.

В 1888 году он сменил Ричарда Хола на посту органиста Утрехтского собора и приобрел известность благодаря своим навыкам органного исполнения. В Утрехте Вагенаар стал преподавателем музыкальной школы в 1896 году, а в 1904 году — ее директором. Он также был назначен в Утрехтский муниципальный оркестр (Utrechtsch Stedelijk Orkest). С 1919 по 1937 год Вагенаар занимал должность директора Королевской консерватории в Гааге. Его учениками были Петер ван Анрой, Эмиль Энтховен, Анри ван Гаудевер, Александр Вормолен, Леон Ортел, Аллард де Риддер, Виллем Пейпер и Бернард Вагенаар.

23 июля 1897 года Вагенаар женился на Дине Петронелле ван Валькенбург. У них родилось две дочери. Он скончался в Гааге.

Композиции Вагенара включают оперы, кантаты, органную музыку и оркестровые произведения. Музыка Эктера Берлиоза оказала на его творчество скромное влияние, однако куда более значительное влияние на него оказал Рихард Штраус.

В свои последние годы Вагенаар получил почетную степень доктора музыки в Утрехтском университете.